Andrés Marín dirige su propia compañía de baile desde 2002. Su primer espectáculo "Más Allá del Tiempo" se estrena en la Maison de la Danse en Lyón. Realiza más de sesenta actuaciones en distintos países con representaciones en la XII Bienal de Flamenco de Sevilla, el Théâtre de la Ville de París, el Festival de Jerez, la Ópera de Lille, y el New World Flamenco Festival de Los Ángeles. Participa en "¡Mira!" en el TNT de Toulouse y en la emisión "Dance Celebration!" para el canal Arte en la Maison de la Danse junto con los coreógrafos Montalvo, Jiri Kylian y Bill T. Jones. Dirige cursos de baile para el Ballet Nacional de España y la Compañía Andaluza de Danza.
En 2004 estrena "Asimetrías" dentro de la XIII Bienal de Flamenco de Sevilla y con gran éxito. De nuevo es acogido por los más prestigiosos escenarios europeos incluyendo el Sadler´s Wells de Londres, el Théâtre de la Ville de Paris, la Maison de la Danse de Lyón, y la Ópera Nacional de Latvia. "Asimetrías" se presenta en el Festival de Jerez y los festivales flamencos de Barcelona, Helsinki, Monterrey, Albuquerque (USA), Düsseldorf y Hamburgo.
El 7 de octubre de 2006 presenta "El Alba del Última Día" en la XIV Bienal del Flamenco de Sevilla. El espectáculo es alabado por los críticos como uno de las mejores propuestas de la Bienal y Andrés como Mejor Bailaor por el Diario de Sevilla. En 2007 el espectáculo se representa en el XVII Festival de Flamenco de Nîmes, en la décima edición de Flamenco Viene del Sur en Granada y Málaga y en el Festival de Flamenco de Monterrey. Durante el verano del mismo año Andrés interpreta a Lorca en "Poeta en Nueva York", obra producida por el Centro Andaluz de Danza bajo la dirección de Blanca Li y organizada por la Consejería de Cultura de la Junta de Andalucía para el ciclo Lorca y Granada en los Jardines del Generalife. A raíz de su participación fue nominado a los Premios Max como Mejor Interpretación Masculina de Danza.
En 2008 la compañía emprende una gira con el espectáculo "El Alba del Último Día" por varios teatros de Holanda y Francia, entre ellos el Montpellier Danse. En España el espectáculo se presenta en el Teatro Villamarta en Jerez dentro de la programación del XII Festival de Jerez y en las XXIV Jornadas Flamencas de Fuenlabrada de Madrid. Marín es invitado a participar en "Le Bal de la Rose", una gala benéfica que organizan anualmente los Príncipes de Mónaco y dedicada este año al director de cine Pedro Almodóvar. Se presenta "Asimetrías" en el Teatro Campoamor dentro del Festival de Danza Oviedo 2008. Marín vuelve a encarnar a Lorca en el espectáculo "Poeta en Nueva York" con el que realiza 10 actuaciones en el Théâtre Chaillot de París. El espectáculo es programado de nuevo para el ciclo estival "Lorca Granada en los Jardines del Generalife" (Alhambra).
Marín estrena "El Cielo de tu Boca" en la XV Bienal de Flamenco en Sevilla, obra que cuenta con el músico experimental, Llorenç Barber. Inaugura la II Bienal de Flamenco de los Países Bajos y presenta el espectáculo en el Festival ¡Mira! en Francia. Compagina su actividad coreográfica y artística con la dirección de Andrés Marín Flamenco Abierto, una oficina de producción y estudio de baile propios con sede en Sevilla.
